Journals

• D. Lavenier, G. Georges, X. Liu, A Reconfigurable Index FLASH Memory tailored to Seed-Based Genomic Sequence Comparison Algorithms, The Journal of VLSI signal processing systems. Special issue on Computing Architectures and Acceleration for Bioinformatics Algorithms, vol 43, issue 3, sept. 2007.
• R. Chikhi, S. Derrien, A. Noumsi, P. Quinton. Combining flash memory and FPGAs to efficiently implement a massively parallel algorithm for content-based image retrieval. International Journal of Electronics, Volume 95, Number 7, July 2008 , pp. 621-635(15)

Conferences

• P. Peterlongo, L. Noé, D. Lavenier, G. Georges, J. Jacques, G. Kucherov, M. Giraud, Protein similarity search with subset seeds on a dedicated reconfigurable hardware, Parallel Bio-Computing, Workshop on Parallel Computational Biology, Gdansk, Poland, September 9-12, 2007
• M. Giraud, G. Kucherov, D. Lavenier, L. Noé, P. Peterlongo, Utilization of Subset Seeds on a Reconfigurable Architecture, LAW 2007 (London Algorithm Workshop), King's College London, UK, February 7-8 2007 (pdf)
• D. Lavenier, X. Xinchun, G. Georges, Seed-based Genomic Sequence Comparison using a FPGA/FLASH Accelerator, International IEEE Conference on Field Programmable Technology (FPT), Bangkok, Thailand, 2006 (pdf)
• G. Georges, S. Derrien, S. Rubini, F. Raimbault, L. Amsaleg, D. Lavenier, ReMIX: une architecture pour la recherche dans les masses de données indexées, Sympa 2006, Symposium en Architecture de Machines, Perpignan, France, 2006. (pdf)
• V.H. Nguyen, D. Lavenier, Recherche dans les banques d'ADN par indexation parallèle, 4th International Conference on research, innovation & vision for the future, Ho Chi Minh Ville, Vietnam, 2006. (pdf)

National Events

• P. Pertelongo, Flash: Optimisation de graines et indexation des banques génomiques sur mémoire flash reconfigurable, Journées nationales des ARC INRIA, Rennes, oct. 2007 (pdf)
• Poster ReMIX : Mémoire Reconfigurable pour l' Indexation des masses de données. Séminaire PaRISTIC, Bordeaux, 21-23 novembre 2005. (pdf)
• E. Popovici, G. Ménier, P.F. Marteau, Recherche approchée d'information dans une base de documents semi-structurés : une application ReMIX. Séminaire PaRISTIC, Bordeaux, 21-23 novembre 2005. (pdf)
• D. Lavenier, ReMiX : Mémoire Reconfigurable pour l' Indexation des masses de données. Journées de l'ACI MD, Paris, 16-17 octobre 2004. (pdf)
• F. Raimbault, D. Lavenier, Le projet ReMIX et ses applications en génomique. Journées de l'Action Spécifique "Indexation de texte et découverte de motifs" (ASIM), Réunion thématique, Faculté des Sciences, Nantes, 27-28 mai 2004. (pdf)